的关键的区别天冬氨酸半胱氨酸和丝氨酸蛋白酶之间的关系是他们的官能团作为催化残留物。作为天冬氨酸蛋白酶催化残基的官能团是a羧酸基,而在半胱氨酸蛋白酶中,硫醇或巯基作为催化残基的官能团,在丝氨酸蛋白酶中,一个羟基基或醇在催化残渣上起官能团的作用。
蛋白酶是催化蛋白质水解的酶,蛋白质水解是将蛋白质分解成更小的多肽或氨基酸。这个过程通过劈开来进行肽债券在蛋白质的水解过程中。蛋白酶参与许多生物功能,如消化摄入的蛋白质,蛋白质的分解代谢和细胞信号。蛋白酶存在于所有形式的生命中。天冬氨酸、半胱氨酸和丝氨酸是三种重要的蛋白酶,在生物体中起着关键作用。
内容
1.概述和主要区别
2.什么是天冬氨酸蛋白酶
3.什么是半胱氨酸蛋白酶
4.什么是丝氨酸蛋白酶
5.相似之处-天冬氨酸半胱氨酸和丝氨酸蛋白酶
6.表格形式的天冬氨酸、半胱氨酸、丝氨酸蛋白酶
7.总结-天冬氨酸、半胱氨酸、丝氨酸蛋白酶
什么是天冬氨酸蛋白酶?
天冬氨酸蛋白酶是一种蛋白质裂解酶。它们在活性位点上有两个高度保守的天冬氨酸,在酸性ph值下具有最佳活性。这些蛋白酶裂解具有疏水残基和-亚甲基的二肽键。天冬氨酸蛋白酶的催化机制是酸碱催化机制。这涉及到水分子与两个天冬氨酸残基的配位。一个天冬氨酸通过移除一个质子来激活水分子。这使得水能够对底物的羰基碳进行亲核攻击。结果,它产生了一个四面体氧阴离子中间体,该中间体通过与第二个天冬氨酸残基形成氢键而稳定。这种中间体的重排是肽分裂成两个肽产物的原因。
天冬氨酸蛋白酶有五个超家族:Clan AA是一个家族,Clan AC是一个信号肽酶II家族,Clan AD是一个早衰素家族,Clan AE是一个GPR肽酶家族,Clan AF是一个omptin家族。
什么是半胱氨酸蛋白酶?
半胱氨酸蛋白酶是一组降解蛋白质的水解酶。它们显示了一种催化机制,包括催化三联体或二联体中的亲核半胱氨酸硫醇。半胱氨酸蛋白酶催化机理的第一步是脱质子化。巯基在酶的活性位点内被邻近的氨基酸(如组氨酸)去质子化,组氨酸有一个基本的侧链。下一步是半胱氨酸的去质子化阴离子硫在底物上的亲核攻击。在这里,底物的片段释放出胺,蛋白酶中的组氨酸残渣恢复其去质子化形式。这导致底物的硫酯中间体的形成,连接新的羧基端到半胱氨酸硫醇。硫酯键水解生成剩余底物碎片上的羧酸部分。
半胱氨酸蛋白酶在生理和发育过程中发挥多种作用。在植物中,它们在贮藏蛋白质的生长、发育、积累和动员中起着重要作用。在人类中,它们在衰老和凋亡、免疫反应、前激素处理和锥体发育的细胞外基质重塑中都很重要。
什么是丝氨酸蛋白酶?
丝氨酸蛋白酶也是一组蛋白水解酶,可以裂解蛋白质中的肽键。丝氨酸是酶活性部位的亲核氨基酸。这些在真核生物和原核生物中都存在。丝氨酸蛋白酶通常根据其独特的结构分为不同的类别,该结构包括在活性催化位点聚合的两个β -桶结构域,也基于其底物特异性。它们是类胰蛋白酶、类凝乳胰蛋白酶、类凝血酶、类弹性蛋白酶和类枯草菌素。
胰蛋白酶类蛋白酶裂解肽键跟随带正电荷的氨基酸如赖氨酸或精氨酸。它们专门针对带负电荷的残留物,如天冬氨酸或谷氨酸。胰凝乳蛋白酶类蛋白酶更疏水。它们的特异性在于大量的疏水残基,如酪氨酸、色氨酸和苯丙氨酸。凝血酶类蛋白酶包括凝血酶,凝血酶是一种组织激活型纤溶酶原和纤溶酶。这些有助于血液凝固和消化也有助于神经退行性疾病的病理生理学。类弹性蛋白酶喜欢丙氨酸、甘氨酸和缬氨酸等残基。类枯草菌素蛋白酶包括原核生物中的丝氨酸。它共享一个催化机制,利用催化三位一体,以产生亲核丝氨酸。丝氨酸蛋白酶活性的调节需要蛋白酶的初始激活和抑制剂的分泌。
天冬氨酸半胱氨酸蛋白酶和丝氨酸蛋白酶有什么相似之处?
- 天冬氨酸、半胱氨酸和丝氨酸蛋白酶通过肽键的裂解催化蛋白质的分解。
- 机制是相似的,活性位点残基攻击肽键,导致其断裂。
- 都含有亲核试剂。
- 它们都是蛋白质。
天冬氨酸半胱氨酸和丝氨酸蛋白酶的区别是什么?
天冬氨酸半胱氨酸和丝氨酸蛋白酶的关键区别在于它们的官能团,即催化残基。天冬氨酸蛋白酶以羧酸基为官能团,半胱氨酸蛋白酶以硫醇或巯基为官能团,丝氨酸蛋白酶以羟基或乙醇为官能团。
天冬氨酸蛋白酶具有天冬氨酸活性位点,而半胱氨酸蛋白酶具有半胱氨酸活性位点。丝氨酸蛋白酶活性位点残基为羟基。因此,这也是天冬氨酸半胱氨酸蛋白酶和丝氨酸蛋白酶的另一个区别。与丝氨酸和半胱氨酸蛋白酶不同,天冬氨酸蛋白酶在分裂过程中不形成共价中间体。因此,天冬氨酸蛋白酶的蛋白质水解只需要一步。
下面的信息图以表格形式展示了天冬氨酸半胱氨酸蛋白酶和丝氨酸蛋白酶之间的差异,以便并排比较.
天冬氨酸半胱氨酸和丝氨酸蛋白酶
蛋白酶是一种催化蛋白质分解成更小的多肽或氨基酸的酶。天冬氨酸半胱氨酸和丝氨酸蛋白酶之间的关键区别是作为它们催化残基的官能团。天冬氨酸蛋白酶的官能团是羧酸基,半胱氨酸蛋白酶的官能团是硫醇或巯基。在丝氨酸蛋白酶中,一个羟基或一个醇作为官能团。
参考:
1.”蛋白酶机制自然新闻,自然出版集团。
2.”半胱氨酸蛋白酶科学指引。
3.”丝氨酸蛋白酶科学指引。
图片来源:
1.”天门冬氨酰蛋白酶机制来自维基百科的英文用户roadnotaken(3.0 CC冲锋队)通过共享维基
2.”Cysteinprotease Reaktionsmechanismus由NEUROtiker -自己的作品(公共领域)通过公共维基媒体
3.”丝氨酸蛋白酶的机理作者:Snellios,英文维基百科(3.0 CC冲锋队)通过共享维基
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