关键区别 - RT PCR与QPCR
聚合酶链反应是一种用于扩增DNA特定区域的技术体外。由于Kary Mullis在1983年发明了这一技术,科学家能够为研究目的将数千份特定的DNA片段副本制成。目前,它已成为针对各种应用的临床和研究实验室中的一种常见且常规的技术。传统有变化PCR技术例如RT PCR,嵌套PCR,多重PCR,Q PCR,RT - QPCR等。RTPCR和Q PCR是PCR的两个重要变化。RT PCR和Q PCR之间的关键区别在于RT PCR用于检测基因表达通过创建互补的DNA((cDNA)来自RNA的笔录尽管Q PCR用于使用荧光染料实时测量PCR产物。
内容
1。概述和关键差异
2。什么是RT PCR
3。什么是qpcr
4。并排比较 - RT PCR与QPCR
5。概括
什么是RT PCR?
逆转录聚合酶链反应(RT PCR)是PCR的变体,用于检测RNA表达。这是检测的非常重要的方法mRNA在组织中的表达。当样品的起始材料为RNA时,使用RT PCR。在RT PCR中,首先将模板mRNA转换为互补DNA。该步骤是由酶逆转录酶催化的,该过程称为逆转录。其次,传统的PCR用于新合成的cDNA进行扩增。
RT PCR是一种高度敏感的技术,需要相对少量的RNA样品。RT PCR通常用于RNA物种的诊断和定量,尤其是RNA病毒,例如人类免疫缺陷病毒和丙型肝炎病毒。
什么是QPCR?
定量PCR(QPCR)是PCR的变体,用于定量测量PCR产物。它也称为实时聚合酶链反应,因为它使用实时PCR机测量实时的扩增。它是确定样品中存在的目标序列或基因的量的合适方法。QPCR的有趣特征是它将放大和真实定量结合到一个步骤中。因此,需要凝胶电泳在检测中可以通过qPCR技术消除。QPCR在PCR反应期间使用荧光染料标记PCR产物,最终导致直接定量。当PCR产物积累时,也会积累荧光信号,并将通过实时机器进行测量。QPCR可以与RT PCR结合使用。它被称为RT - QPCR或QRT - PCR,被认为是一种检测细胞或组织中RNA水平的最强大,敏感和定量方法。
Sybr Green和Taqman是用于检测或观察实时PCR扩增过程的两种方法。使用称为SYBR绿色的荧光染料进行SYBR绿色方法,并通过结合染料产生双链DNA来检测扩增。塔克曼使用双标记探针进行,并通过通过降解来检测探针的扩增TAQ聚合酶如图02所示,荧光团的释放。这两种方法都监测扩增过程的进度并实时报告产品的数量。
实时PCR具有多种应用,例如基因表达定量,microRNA和非编码RNA分析,SNP基因分型,检测拷贝数变体,稀有检测突变,检测转基因生物,传染剂的检测等。
RT PCR和QPCR有什么区别?
RT PCR与QPCR |
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RT PCR是一种用于通过扩增检测基因表达的技术。 | QPCR是一种实时放大DNA并量化PCR产物的技术。 |
逆转录酶的参与 | |
酶逆转录酶用于RT PCR。 | 酶逆转录酶不用于QPCR。 |
使用荧光标记的分子 | |
荧光标记的染料或探针不用于RT PCR。 | 荧光标记的染料或探针用于QPCR。 |
量化PCR产品 | |
除非与QPCR结合,否则RT PCR不会量化PCR产物。 | QPCR定量测量PCR产品。 |
起始材料 | |
起始材料是mRNA。 | 起始材料是DNA。 |
cDNA的合成 | |
在RT PCR期间产生互补的DNA。 | QPCR期间未产生互补的DNA。 |
摘要 - RT PCR与QPCR
RT PCR和QPCR是传统PCR的两个版本。RT PCR技术是针对mRNA样品进行的,它是由cDNA的逆转录和产生驱动的。QPCR用于使用荧光染料或标记的探针实时PCR热周期来量化PCR产物。在QPCR中,PCR产物的量由样品以发射的荧光信号表示。RT PCR通常用作放大过程,而QPCR通常用作定量过程。这是RT PCR和QPCR之间的差异。
参考:
1. Deepak,SA,Krkottapalli,R。Rakwal,G。Oros,KS Rangappa,H。Iwahashi,Y。Masuo和GK Agrawal。“实时PCR:革新基因的检测和表达分析。”当前的基因组学。Bentham Science Publishers Ltd.,2007年6月。2017年4月3日
2. Zeka,Fjoralba,Katrien Vanderheyden,Els de Smet,Claude A. Cuvelier,Pieter Mestdagh和Jo Vandesompele。“基于FFPE样品的基于直接敏感的RT-QPCR基因表达分析。”自然新闻。自然出版集团,2016年2月22日。2017年4月3日
3. Overbergh,L.,A。Giulietti,D。Valckx,B。Decallonne,R。Bouillon和C. Mathieu。“使用实时逆转录酶PCR来定量细胞因子基因表达。”生物分子技术杂志:JBT。生物分子资源设施协会,2003年3月。2017年4月3日
图片提供:
1.用户的“ taqman”:脑损伤 - 原始上传者(公共领域)通过下议院维基梅迪亚
2. JPARK623的“逆转录聚合酶链反应” - 自己的工作(CC BY-SA 3.0)通过下议院维基梅迪亚
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