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之间的区别

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MLVA和MLST的区别是什么

2022年5月24日发布的Dr.Samanthi

的关键的区别MLVA和MLST之间MLVA使用的是多态性串联重复的DNA序列来表征微生物种类,而MLST则是利用多个微生物内部片段DNA序列的多态性管家基因描述微生物种类。

微生物分型通常用于确定感染的来源和途径。它证实或排除了疫情。微生物分型还可追踪与卫生保健相关的交叉传播病原体并识别毒性菌株。此外,微生物分型还评价了病原微生物种控制措施的有效性。MLVA和MLST是用于微生物分型的两种分子生物学技术。

内容

1.概述和主要区别
2.什么是MLVA
3.什么是MLST
4.相似点- MLVA和MLST
5.表格形式的MLVA vs MLST
6.总结- MLVA vs MLST

MLVA是什么?

多位点VNTR分析MLVA是一种利用串联重复DNA序列的多态性来表征微生物种类的分子生物学方法。它是一种用于特定微生物物种遗传分析的方法。

在MLVA的第一步,每个目标VNTR用侧翼区域特异性引物PCR扩增基因座。然后在毛细管测序仪上进行电泳分离。每个位点的基因分型和从每个样本编译的结果允许对一个已知物种的微生物进行表征。它还允许通过等位基因分型和与MLVA数据库的比较来识别亚种。

表格形式的MLVA vs MLST

图1:MLVA

这种MLVA方法比MLST方法更具选择性。此外,MLVA方法不需要DNA测序步骤。因此,它使区分接近的亚种或克隆种成为可能。

MLST是什么?

茎序列类型MLST是一种利用多个管家基因内部片段的DNA序列多态性来表征微生物物种的技术。MLST是一种用于多位点分型的遗传分析技术。

MLVA和MLST的并列比较

图2:MLST

它是一种测序分型,用作区分不同菌株的微生物种类的参考技术。该方法基于管家基因测序。家务管理基因通常编码微生物制剂(如细菌)的基本蛋白质。这些管家基因序列具有随时间推移呈现稳定多态性的特殊性。因此,管家基因序列的差异足以区分菌株之间的差异。此外,第一个MLST方案的发展是脑膜炎奈瑟菌,脑膜炎球菌性脑膜炎和败血症的病原体。自MLST问世以来,它不仅被用于人类病原体,也被用于植物病原体。

MLVA和MLST有什么相似之处?

  • MLVA和MLST是用于微生物分型的两种分子生物学技术。
  • 这两种技术都可用于微生物系统发育分析。
  • 这两种技术都是基于遗传多态性。
  • 它们可用于检测引起微生物病原体的人类疾病。
  • 这两种技术都应该由熟练的分子生物学家来完成。

MLVA和MLST的区别是什么?

MLVA是一种利用串联重复DNA序列的多态性来表征微生物种类的技术。同时,MLST是一种利用多个管家基因内部片段DNA序列的多态性来表征微生物物种的技术。因此,这是MLVA和MLST之间的关键区别。此外,MLVA方法比MLST方法更具选择性。

下面的信息图以表格形式展示了MLVA和MLST之间的差异,以便并排比较。

总结- MLVA vs MLST

MLVA和MLST是用于微生物分型的两种分子生物学技术。MLVA利用串联重复DNA序列的多态性来表征微生物种类,而MLST则利用多个管家基因内部片段DNA序列的多态性来表征微生物种类。这就是MLVA和MLST的关键区别。

参考:

1.”多位点变数串联重复分析(MLVA)“美国疾病控制和预防中心,美国疾病控制和预防中心,2016年2月16日。
2.”茎序列类型“ScienceDirect主题概述”。

图片来源:

1.”1993年48株龟堂分离株基因型(CC0)通过Picryl
2.”fmicb - 04 - 00414 - g001 (14424086445)通过系统发育图- fmicb-04-00414-g0012.0 (CC)通过共享维基

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了下:分子生物学

关于作者:Dr.Samanthi

samanthi Udayangani博士拥有植物科学学士学位、分子与应用微生物学硕士学位和应用微生物学博士学位。主要研究方向为生物肥料、植物-微生物相互作用、分子微生物学、土壤真菌和真菌生态学。

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