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RAPD和RFLP之间的差异

2017年4月17日发表Samanthi博士

关键区别 - RAPD与RFLP

遗传标志物用于分子生物学中,以鉴定个体和物种之间的遗传变异。随机扩增多态性DNA(RAPD)和限制片段长度多态性(RFLP)是实验室通常使用的两个重要分子标记。RAPD用短而任意的寡核苷酸进行底漆,并且基于整个模板中多个位置的随机扩增脱氧核糖核酸有机体。RFLP具有特定的限制核酸内切酶,它是基于多态性由此产生的限制片段和杂交。RAPL和RFLP之间的关键区别在于RAPD是一种pcr没有先前的序列知识执行的技术然而RFLP不参与PCR,需要先前的序列知识来执行该技术。

内容
1。概述和关键差异
2。什么是Rapd
3。什么是RFLP
4。并排比较 - RAPD与RFLP
5。概括

什么是Rapd?

RAPD是分子生物学中有用的分子标记。这是一种快速简便的技术。RAPD可以定义为一种方法,该方法由于目标DNA模板的多个位置随机扩增而导致多态DNA序列。RAPD使用具有PCR扩增的任意序列的短寡核苷酸引物。没有先前的序列知识,可以人为地合成引物。因此,它被认为是一种简单且有用的技术。

RAPD涉及以下主要步骤。

  1. 提取靶DNA
  2. 使用随机选择的引物扩增靶DNA的多个位置
  3. 凝胶电泳放大的PCR产品
  4. 用溴化乙锭染色并鉴定多态性

由于引物退火的变化,在扩增过程中会产生不同长度的不同片段。因此,凝胶上的带状模式在个体和物种之间是不同的。因此,RAPD可以在鉴定和分化中检测生物体之间的遗传变异。

RAPD应用于分子生物学的各种研究,例如鉴定密切相关的物种,基因映射,DNA指纹,遗传性疾病的鉴定等之间的遗传差异等。

RAPD和RFLP之间的差异

图01:RAPD

什么是RFLP?

限制片段长度多态性(RFLP)是用于鉴定同源DNA序列遗传变异的分子生物学中的分子标记。这是为DNA指纹识别开发的第一个遗传标记。当受到特定限制酶限制时,所有生物都会产生独特的DNA谱。RFLP是产生个体独特的DNA谱并检测遗传变异的重要工具。当DNA样品用特定的限制性核酸内切酶消化时,它会产生不同的DNA曲线,这些DNA轮廓是每个个体所独有的。因此,该方法的主要因素是通过限制具有特定限制酶的同源DNA来检测生物体之间的遗传变异,并通过凝胶电泳和印迹分析片段长度多态性。斑点模式是每个生物体所独有的,并表征了特定的基因型。

RFLP涉及以下步骤。

  1. 从样品中分离出足够量的DNA
  2. 具有特定限制性核酸内切酶的DNA样品的碎片分解为短序列
  3. 分离所得片段,长度不同琼脂糖凝胶电泳。
  4. 通过Southern印迹将凝胶曲线转移到膜中
  5. 膜与标记的探针的杂交以及对每个轮廓中片段长度多态性的分析

RFLP具有各种应用,例如诊断遗传疾病,基因组映射,法医研究中的犯罪鉴定,亲子鉴定等。

关键区别 -  RAPD与RFLP

图02:RFLP基因分型

RAPD和RFLP有什么区别?

RAPD vs RFLP

RAPD是基于随机引物和PCR的分子标记。 RFLP是基于不同长度限制片段的产生的分子标记。
所需的样本
小型DNA样品足以进行RAPD分析。 RFLP分析需要大量提取的DNA样品。
时间
RAPD是一个快速的过程。 RFLP是一个耗时的过程。
底漆使用
使用随机引物,可以将相同的引物用于不同的物种。 物种特异性探针用于RFLP进行杂交。
可靠性
与RFLP相比,该技术的可靠性较小。 RFLP是一种可靠的技术。
吸毒
RAPD涉及南方墨。 Southern印迹是RFLP的一步。
检测等位基因变异
RAPD无法检测到等位基因变化。 RFLP可以检测到等位基因变化。
需要序列知识
RAPD不需要事先的序列知识。 探针设计需要先前的序列知识。
pcr
PCR参与RAPD PCR不参与RFLP。
可重复性
RAPD的可重复性低 与RAPD相比,RFLP具有很高的可重复性。

摘要 - RAPD与RFLP

RAPD和RFLP是分子生物学中使用的重要标记。两种方法都能够检测生物体之间的遗传变异。RAPD是使用随机引物进行的。使用特定限制酶进行RFLP。两种方法都产生了单个生物独有的DNA谱。RAPD比RFLP涉及的步骤相当几。但是,与RFLP相比,它产生的可靠和可重现结果较少。这是RAPD和RFLP之间的主要区别。

参考:
1. Dos,J。B.,J。Nienhuis,P。Skroch,J。Tivang和M. K. Slocum。“ RAPD和RFLP遗传标记在确定甘蓝橄榄核基因型之间的遗传相似性方面的比较。”标签。理论和应用遗传学。理论和Angewandte Genetik。美国国家医学图书馆,1994年3月。2017年4月12日
2. Powell,Wayne,Michele Morgante,Chaz Andre,Michael Hanafey,Julie Vogel,Scott Tingey和Antoni Rafalski。“ RFLP,RAPD,AFLP的比较

图片提供:
1.(未知) - 国立卫生研究院(公共领域)的“ RFLP基因分型”下议院维基梅迪亚

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关于作者:Samanthi博士

Samanthi Udayangani博士拥有B.Sc.植物科学学位,硕士在分子和应用微生物学和应用微生物学中的博士学位。她的研究兴趣包括生物肥料,植物 - 微生物相互作用,分子微生物学,土壤真菌和真菌生态学。

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