细菌转座酶和逆转录病毒整合酶|的差异比较相似术语之间的差异

关键区别-细菌转座酶vs逆转录整合酶

可迁移的遗传物质进化出了两种主要策略，即从一个区域迁移到另一个区域基因组．一种方法是在一个RNA分子形成之前通过一个置换DNA其他途径涉及DNA中间体。转座酶和病毒整合酶就是这种转座遗传物质的例子。细菌转座酶结合在末端转座子并通过各种机制催化转座子运动到基因组的另一部分。逆转录病毒整合酶是酶这有助于整合人类的遗传物质逆转录酶病毒如艾滋病毒进入它感染的宿主细胞的遗传物质(DNA)。这是关键的区别在细菌转座酶和逆转录病毒整合酶之间。

内容

1.概述及关键区别
2.什么是细菌转座酶
3.什么是逆转录病毒整合酶
4.细菌转座酶与逆转录病毒整合酶的相似性
5.并列比较-细菌转座酶和逆转录病毒整合酶的表格形式
6.总结

什么是细菌转座酶?

转座子酶是一种结合在转座子末端的酶，通过各种机制催化转座子运动到基因组的另一部分。这些机制包括“剪切和粘贴机制”和“复制转位机制”。转座酶是通过克隆Tn3转座所需的酶引入的。转座基因利用了两种重要的策略来实现基因组之间的位移或从一个位点到另一个位点。在合成DNA副本之前，通过RNA中间体运输是一种策略，而另一种策略是单独与DNA中间体结合。的复合参与两种元素整合的反应是由于元素特异性酶而发生的。因此，在一个DNA元素的例子中，这些酶被称为转座酶，而在一个RNA元素的例子中，它们被称为整合酶。

当比较两种转位策略的差异时，插入过程在化学上似乎是相同的。但是，最近的证据提出，在一体化机制上的某些相似性在区域氨基酸形成活性位点的序列;DDE的主题。目前转座酶已被划分为5个科，但出现新的转座酶性状的科数尚未增加。这些家族包括DDE转位酶，酪氨酸(Y)转座酶，丝氨酸(S)转座酶，Rolling circle转座酶，反转录酶/内切酶(RT / En)等。这些家族利用独特的催化机制来断裂和重新连接DNA。DDE转位酶参与原转位的剪切粘贴机制，携带三组保守的氨基酸，即;天冬氨酸(D)，天冬氨酸(D)和谷氨酸(E).酪氨酸转座酶也通过酪氨酸残基的利用参与剪切和粘贴机制，这是位点特异性的。

图01:细菌转座酶

丝氨酸转座酶与上述家族一样，涉及到环状DNA的中间体，并进行剪切和粘贴机制。滚环转位酶参与复制入机制，单链通过DNA复制直接复制到目标位点。这就保证了模板链和复制的链有一个新合成的链。逆转录酶/内切酶转位酶具有多种转位机制。

什么是逆转录病毒整合酶?

在逆转录病毒整合酶的范围内，它被认为是一种逆转录病毒酶，有助于将逆转录病毒(如HIV)的遗传物质整合到被感染细胞的遗传物质(DNA)中。这些逆转录病毒整合酶最常与噬菌体整合酶混淆。噬菌体整合酶的例子是λ噬菌体整合酶。但它们是完全不同的酶，不应该混淆。在逆转录病毒整合前复合体的形成过程中，逆转录病毒整合酶起着重要作用。逆转录病毒整合酶蛋白质通常由三个典型结构域组成。这些域由灵活的连接器连接。

这三个结构域包括一个N端锌结合结构域，其中三个螺旋束在锌的参与下相互连接并稳定^{2 +}阳离子,核糖核酸酶H折叠催化核心结构域和C端DNA结合结构域，即SH3折叠。通过研究和生化和结构信息，提示逆转录病毒整合酶具有二聚体中的二聚体(四聚体)的功能。在多聚化和病毒DNA结合的背景下，逆转录病毒整合酶蛋白的所有三个结构域。逆转录病毒整合酶的主要功能是将其遗传物质插入宿主DNA。这一步是HIV病毒复制过程中最关键的一步。一旦成功整合，它将在细胞的染色体DNA中度过余生。

图02:逆转录病毒整合酶

因此，一旦集成，就没有回报的细胞。这些逆转录病毒整合酶参与两种主要反应的催化，包括3 '端加工和共价连接。3 '端加工，2-3核苷酸去除病毒DNA的3’端，以揭示病毒DNA 3’端的CA二核苷酸，在共价连接过程中，经过处理的病毒DNA 3’端以共价连接到宿主染色体DNA中。

细菌转座酶和逆转录病毒整合酶有什么相似之处?

细菌转座酶和逆转录病毒整合酶具有相似的氨基酸序列。

细菌转座酶和逆转录病毒整合酶有什么区别?

细菌转座酶vs逆转录病毒整合酶
细菌转座子酶是一种结合在转座子末端的酶，通过各种机制促进转座子向基因组的另一部分移动。	逆转录病毒整合酶被认为是一种逆转录酶，它帮助将逆转录病毒(如HIV)的遗传物质整合到被感染细胞的遗传物质(DNA)中。
结合区域
细菌转座酶需要高特异性结合区。	结合所需的核苷酸序列较少或不需要。

总结——细菌转座酶vs逆转录整合酶

细菌转座酶被认为是一种逆转录酶，它有助于将逆转录病毒(如HIV)的遗传物质整合到被感染细胞的遗传物质(DNA)中。转座基因利用了两种重要的策略来实现基因组之间的位移或从一个位点到另一个位点。目前转座酶已被划分为5个科，但出现新的转座酶性状的科数尚未增加。逆转录病毒整合酶，被认为是一种逆转录酶，它帮助将逆转录病毒(如HIV)的遗传物质整合到被感染细胞的遗传物质(DNA)中。逆转录病毒整合酶蛋白质通常由三个典型结构域组成。逆转录病毒整合酶的主要功能是将其遗传物质插入宿主DNA。这一步是HIV病毒复制过程中最关键的一步。因此，一旦集成，就没有回报的细胞。这就是细菌转座酶和逆转录病毒整合酶的区别。

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参考:

1.Vigil-Stenman, Theoden等，“波罗的海细菌转座酶的高丰度和表达。”《ISME期刊》第11卷第1期。11, 2017, pp. 2611-2623。，doi:10.1038/ismej.2017.114.
2.波拉德，P和M钱德勒。"细菌转座酶和逆转录病毒整合酶"分子微生物学。，U.S. National Library of Medicine, Jan. 1995.可以在这里
3.Andrake, Mark D.和Anna Marie Skalka。《逆转录病毒整合酶:过去和现在》《病毒学年度评论》第2卷第1期。2015年9月1日，第241-264页。，doi:10.1146/annurev-virology-100114-055043.