的关键的区别生物信息学中同源性和相似性之间的关系是同源性指的是关于两个序列的共同进化祖先的陈述,而相似性指的是两个序列之间的相似程度。
生物信息学是一门结合生物学、信息工程、计算机科学、数学和统计学来分析和解释生物数据的科学。同源性和相似性是我们在生物信息学领域使用的两个术语。我们可以很容易地计算相似性作为相似残差的百分比超过一个给定长度的对齐。然而,我们不能计算同源性,因为它可能是真的或假的,通常取决于使用的假设。
内容
1.概述及关键区别
2.什么是生物信息学中的同源性
3.什么是生物信息学中的相似性
4.生物信息学中同源与相似的相似性
5.并列比较-表格形式的生物信息学的同源与相似
6.总结
什么是生物信息学中的同源性?
生物信息学中的同源性是指生物之间的同源性DNA, RNA和蛋白质序列是根据生命进化树中共享的祖先属性来定义的。换句话说,它是两个序列的共同进化祖先。发生这种情况的原因可能是由于物种形成事件(直接同源),水平基因转移事件(xenlog)或重复事件(parogs)。
可以通过DNA、RNA或蛋白质的氨基酸或核苷酸序列相似性来推断它们之间的同源性。显著的相似性是一个强有力的证据属性,可以推断两个序列与一个具有进化变化的共同祖先序列有关。多个序列的比对表明每个序列具有同源性的区域。
什么是生物信息学中的相似性?
在生物信息学中,相似性评估两个蛋白质或核苷酸序列之间的相似性。这个过程有两个主要步骤。第一步是成对比对,这有助于找到两个序列(包括间隙)之间的最佳比对算法,如爆炸,FastA, LALIGN。两两比对后,需要从每一对比对中获得两个定量参数。它们是同一性和相似性。在BLAST中,搜索相似性被称为阳性。
保守突变是指氨基酸突变为类似的残基,但保留其理化性质。例如,如果精氨酸突变为带+1正电荷的赖氨酸,它是可以接受的,因为这两种氨基酸在性质上是相似的,不会改变翻译的蛋白质。因此,相似性测量依赖于两个氨基酸残基之间的相似性标准。
生物信息学中同源和相似之间有哪些相似之处?
- 同源性和相似性是我们在生物信息学中遇到的两个专业术语。
- 此外,这两个术语都涉及序列的分子分析。
生物信息学中同源性和相似性的区别是什么?
同源性是指关于两个序列的共同进化祖先的陈述,而相似性是指两个序列之间的相似程度。这就是生物信息学中同源性和相似性的关键区别。此外,同源性无法计算,因为它可能是真或假,通常取决于假设,而相似度可以很容易地计算为一个相似残差的百分比超过一个给定长度的对齐。因此,这是生物信息学中同源性和相似性的显著区别。
下面的信息图表列出了生物信息学中同源性和相似性的区别。
摘要-生物信息学中的同源性与相似性
总之,生物信息学中同源和相似的关键区别在于它们的定义。同源性是两个序列的共同进化祖先的陈述,而相似性是两个序列之间的相似性。同源性是由于同源性、旁系同源性和异种同源性引起的。在推断相似性时,可以使用FastA、BLAST和LALIGN等算法。同源性不能表示为计算,但相似性可以表示为一个百分比的相似残基超过一个给定的长度对齐。因此,这是对生物信息学中同源性和相似性差异的总结。
参考:
1.“同族体”。同系物——生物信息学。Org维基,可以在这里.
2.“同一性和相似性——一种定量测量。”同一性和相似性——一种定量度量,可以在这里.
图片来源:
1.“TMEM66蛋白的多序列比对摘录”由Wikid25 -开源ClustalW和序列从公共NCBI蛋白数据库(CC0) via下议院维基
2.“全球两两对齐”由Alfat003 -自己的工作(4.0 CC冲锋队)通过下议院维基
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