这关键区别在代谢通量分析和通量平衡分析之间是代谢通量分析是一种成像通量技术,用于分析生产和消费率代谢物在生物系统中,尽管通量平衡分析是一种数学通量技术,用于分析通过代谢网络分析代谢物的流动。
通量学是指确定生物系统中代谢反应速率的各种方法。通量学的重要性是代谢通量通常决定细胞表型。代谢通量是代谢网络中的代谢物转化率。有两种重要的通量学或通量分析技术。它们是代谢通量分析和通量平衡分析。
内容
1。概述和关键差异
2。什么是代谢通量分析
3。什么是通量平衡分析
4。相似性 - 代谢通量分析和通量平衡分析
5。代谢通量分析与表格形式的通量平衡分析
6。摘要 - 代谢通量分析与通量平衡分析
什么是代谢通量分析?
代谢通量分析(MFA)是一种成像通量技术,可分析生物系统中代谢物的生产和消耗率。该技术允许定量细胞内水平的代谢产物。因此,该技术阐明了中央代谢细胞。在代谢通量分析中,13基于C通量的方法通常用于通量分析。在13c通量学,代谢前体富含13c在引入生物系统之前。后来,使用质谱和核磁共振光谱等成像技术,掺入水平13测量C成代谢物。
另外,可以通过化学计量法测量代谢通量。在代谢通量分析中,化学计量模型和质谱法确定了在代谢网络中含有同位素示踪剂从一种代谢物进入另一种代谢物的部分转移。因此,该技术可以得出有关整个代谢网络和细胞表型的信息。此外,代谢通量分析具有许多应用。该技术可以确定生物系统产生生化剂(如乙醇)的能力的局限性。除此之外,该技术还可以预测对基因添加或敲除的反应。
什么是通量平衡分析?
通量平衡分析(FBA)是一种数学通量技术,可通过代谢网络分析代谢物的流动。它是通过两个步骤过程完成的。在第一步中,代谢反应以数值矩阵的形式表示,其中包含每个反应的化学计量系数。这些化学计量系数对系统模型施加了约束。通过提供这样的约束,可以减少系统的解决方案。在第二步中,随着约束的添加,系统模型得到了优化。通量平衡分析通过使用上述机制计算代谢网络中代谢产物的流动。因此,可以通过FBA预测生物体的生长速率或生物技术重要的代谢物的生产率。
通量平衡分析的资源包括BIGG数据库,COBRA工具箱和FASIMU(FBA仿真软件代谢组学)。通量平衡分析在生理研究,差距填充工作和基因组规模合成生物学方面具有多种用途。此外,FBA还可以用于预测重要辅助因子的产量,例如ATP,NADH或NADPH。
代谢通量分析与通量平衡分析之间的相似性
- 代谢通量分析和通量平衡分析是通量分析技术。
- 两种技术都属于系统生物学领域
- 这些技术可以确定生物系统中的代谢通量。
- 这些技术具有广泛的应用。
- 两种技术都可以确定细胞表型。
代谢通量分析和通量平衡分析之间的差异
代谢通量分析是一种成像通量技术,用于分析生物系统中代谢产物的生产和消耗率,而通量平衡分析是一种数学通量技术,可通过代谢网络分析代谢物的流动。因此,这是代谢通量分析和通量平衡分析之间的关键区别。此外,代谢通量分析使用质谱或核磁共振来确定代谢通量,而通量平衡分析使用数学(数值)基质来确定代谢通量。
以下信息图列出了代谢通量分析与助图平衡分析以表并排比较的表格形式之间的差异。
摘要 - 代谢通量分析与通量平衡分析
通量分析(通量)技术用于确定生物系统内代谢反应的速率。有两种主要的通量分析技术。它们是代谢通量分析和通量平衡分析。代谢通量分析是一种成像通量技术,用于分析生物系统中代谢产物的生产和消耗率,而通量平衡分析是一种数学通量技术,用于通过代谢网络分析代谢物的流动。因此,这总结了代谢通量分析和通量平衡分析之间的差异。
参考:
1.“”代谢通量分析。”概述|ScienceDirect主题。
2. Orth,Jeffrey D等。“什么是通量平衡分析?“自然生物技术,美国国家医学图书馆,2010年3月。
图片提供:
1.“”星形胶质细胞与神经元之间的代谢相互作用与主要反应”来自期刊文章中的图(请参阅来源)。文章的作者:Tunahan Cakir,Selma Alsan,Hale Saybasili,Ata Akin,Kutlu Ulgen - Cakir,Tunahan;Selma Alsan,Hale Saybasili,Ata Akin,Kutlu Ulgen(2007)。“星形胶质细胞和神经元代谢途径之间耦合的重建和通量分析:对脑缺氧的应用” - 理论生物学和医学建模4(1):48。doi:10.1186/1742-4682-4-48。ISSN 1742-4682。检索到2007-12-17(CC由2.0)通过Commons Wikimedia
2.“”FBA数学的结果” Thomasf2811 - 自己的作品(CC BY-SA 3.0)通过Commons Wikimedia
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