HG19和HG38 |的区别是什么

的关键的区别介于HG19和HG38之间HG19是一个有7个交替位点的人类参考基因组，而HG38是一个有207个交替位点的人类参考基因组。

参考基因组在为系统发育和生物信息学分析绘制DNA序列方面发挥着重要作用。它代表了生物体的一整套基因。换句话说，它是基因组生物体的序列。有不同的参考全基因组可免费用于基因组制图。NCBI的RefSeq数据库是这类参考基因组的常见来源之一。它包括不同生物的参考基因组，包括原核生物、真核生物和病毒。参考人类基因组主要有两种类型:HG19或GRCh37和HG38或GRCh38。它们是基因组参考联盟(GRC)开发的人类基因组集合。

内容

1.概述和主要区别
2.什么是HG19
3.什么是HG38
4.相似点- HG19和HG38
5.表格形式的HG19 vs HG38
6.总结- HG19 vs HG38

HG19是什么?

HG19，也被称为基因组参考联盟人类构建37 (GRCh37)，是基因组参考联盟于2009年发布的参考基因组。这是一个具有交替位点的单倍体基因组。有7个区域描述了HG19参考基因组中的交替位点。通过测序获得HG19参考基因组克隆从人类基因组计划中获得的。此外，PCR产物和猎枪序列也被用于构建HG19参考基因组。

HG19参考基因组总序列长度为3,101,788,170 bps，由249个支架组成。此外，支架之间有271个缝隙。考虑到组成序列的克隆数，有27,054个克隆。参考基因组由24条染色体组成质粒．

HG38是什么?

HG38，又称基因组参考联盟人类构建38 (GRCh38)，是基因组参考联盟在2017年开发的最新的人类参考基因组。基因组中添加了几个位点，并于2022年3月发布了最新的更新。有207个区域描述了交替位点，比HG19版本有了很大的改进。HG38参考基因组在基因组中有349个缺口。这些间隙大多在端粒、着丝粒和长重复序列之间。PCR产物和霰弹枪序列被用来填补必要的空白。

图2:HG38

HG38参考基因组总序列长度为3099,734,149 bps，由473个支架组成。考虑到组成序列的克隆数，有35614个克隆。HG38参考基因组由24条染色体和质粒组成。

HG19和HG38有什么相似之处?

HG19和HG38是DNA序列。
这两个基因组都是在人类基因组计划完成后获得的。
此外，它们还可以作为人类基因组的参考序列。
这两个序列都是由基因组参考联盟开发的。
此外，它们由参考基因组中的缺口组成。
HG19和HG38的基因组中都有24条染色体和质粒。
HG19和HG38在生物信息学和系统发育分析中有着广泛的应用。

HG19和HG38有什么区别?

HG19参照基因组有7个交替位点区，HG38参照基因组有207个交替位点区。因此，这是HG19和HG38的关键区别。HG19参考基因组是2009年开发的，而HG38参考基因组是2017年开发的。此外，HG19基因组的支架之间有271个缺口，而HG38基因组的支架之间有349个缺口。

下面的信息图以表格形式将HG19和HG38的差异进行并排比较．

总结- HG19 vs HG38

HG19和HG38是基因组参考联盟开发的人类参考基因组。为了完成生物信息学和系统发育分析，它们在人类基因定位中起着重要作用。HG19参照基因组有7个区域，位点交替。HG38参照基因组有207个区域，其位点交替。HG19参考基因组于2009年开发，而HG38参考基因组于2017年开发。每个参考基因组支架之间的间隙数量也不同。在这方面，HG38有更多展现先进性能的缺口。所以，这总结了HG19和HG38的区别。

参考:

1.Caetano-Anolles,德里克。”人类基因组参考构建- GRCH38或hg38 - B37,“GATK。
2.努尔克，谢尔盖等人。“人类基因组的完整序列。冷泉港实验室BioRxiv。
3.”GRCH37 - HG19 -基因组-组装- NCBI美国国家医学图书馆国家生物技术信息中心。
4.”GRCH38 - hg38 -基因组组装- NCBI美国国家医学图书馆国家生物技术信息中心。