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常规嵌套和实时PCR分析有什么区别

2021年9月21日发表Samanthi博士

这关键区别在常规嵌套和实时PCR分析之间是传统的PCR是一种开发用于扩增DNA和嵌套PCR的特定序列的技术,是传统PCR的修饰,由两个顺序扩增反应组成,而实时PCR是常规PCR的变体,能够量化扩增的产物的量化。。

PCR是一种非常常见的科学技术,在研究和医学中广泛用于检测DNA。PCR测试用于检测抗原的检测DNA或RNA。通常,在检测抗体或表现出疾病症状之前,体内存在病毒RNA。PCR测试可以说明某人是否早期患有病毒。目前,PCR是检测的标准测试新冠肺炎疾病。有不同类型的PCR技术,例如实时PCR,嵌套PCR,多重PCR,热启动PCR和远程PCR等。

内容

1。概述和关键差异
2。什么是常规的PCR分析
3。什么是嵌套的PCR分析
4。什么是实时PCR分析
5。相似性 - 常规嵌套和实时PCR分析
6。常规与嵌套与实时PCR分析的表格形式
7。摘要 - 传统与嵌套与实时PCR分析

什么是常规的PCR分析?

常规PCR分析是体外DNA扩增技术通常在分子生物实验室中进行。该方法使得能够生产数千至数百万个特定DNA片段的副本。卡里·穆利斯(Kary Mullis)在1980年引入了这一技术。该技术需要一个称为模板的DNA片段才能制作许多副本。TAQ聚合酶用作DNA聚合酶酶的工作,并催化模板序列的新链的合成。

PCR混合物中的底漆将作为片段扩展的起点。PCR混合物中包括制作DNA拷贝所需的所有成分。PCR反应在PCR机器中进行,并应使用正确的PCR混合物和正确的PCR程序喂食。如果反应混合物和程序是正确的,则将从非常少量的DNA中产生DNA的特定部分的所需数量。

传统嵌套和实时PCR分析之间的差异

图01:常规PCR分析

PCR反应涉及三个主要步骤:变性,底漆退火和链延伸。这三个步骤在三个不同的温度下发生。PCR缓冲液保持TAQ聚合酶作用的最佳条件。重复PCR反应的这三个阶段,以产生所需量的PCR产物。在每个PCR反应中,DNA的数量副本会加倍。因此,可以在PCR中观察到指数扩增。PCR产品可以使用凝胶电泳由于它在凝胶上产生可见量的DNA,并且可以纯化用于进一步的研究,例如测序。

PCR是医学和生物学研究中的宝贵工具。尤其是在法医研究中,PCR具有巨大的价值,因为它可以扩增DNA,以从犯罪分子的微小样本中进行研究并制作法医DNA谱。PCR广泛用于分子生物学的许多领域,包括基因分型,基因克隆,突变检测,DNA测序,DNA微阵列和亲子关系测试。

什么是嵌套的PCR分析?

嵌套PCR是一种降低DNA的非特异性扩增的PCR。嵌套PCR分析中有两个连续的PCR或两个顺序扩增反应。在第一个扩增反应期间,产生PCR产物。第一个反应后,对第一反应的PCR产物进行了第二个扩增反应。因此,第二个反应混合物中的底漆与第一个PCR产物结合并放大。

常规与嵌套与实时PCR分析的表格形式

图02:嵌套PCR

底漆对在每个反应中都是不同的。嵌套PCR中引物的非特异性结合降低。嵌套的PCR分析对于提高灵敏度和/或特异性很有用。但是,嵌套的PCR需要有关感兴趣的序列的知识。

什么是实时PCR分析?

实时PCR或定量PCR(Q PCR)是PCR的修改版本,可定量测量PCR产品。因此,该技术使用实时PCR机器实时量化扩增。它也是确定样品中存在的目标序列或基因的量的合适方法。

实时PCR的有趣特征是,它将放大和真实量化结合到一个步骤中。因此,实时PCR技术可以消除对凝胶电泳检测的需求。在PCR反应期间,使用荧光染料标记PCR产物,最终将导致直接定量。当累积PCR产品时,也会积累荧光信号,并将通过实时机器进行测量。SYBR Green和Taqman是检测或观察实时PCR扩增过程的两种方法。两种方法都监测放大过程的进度,并实时报告产品的数量。

常规嵌套和实时PCR分析 - 并排比较

图03:实时PCR

实时PCR具有多种应用,例如基因表达定量,microRNA和非编码RNA分析,SNP基因分型,拷贝数变异的检测,罕见突变的检测,遗传修饰的生物的检测以及传染剂的检测。

常规嵌套和实时PCR分析之间有什么相似之处?

  • 嵌套和实时PCR分析是常规PCR分析的修改。
  • 这三种技术都放大了DNA样品。
  • 他们的产品可用于测序或分析。
  • 这些测定需要底漆。

常规嵌套和实时PCR分析有什么区别?

常规PCR是一种用于扩增DNA的特定序列的技术。同时,嵌套PCR是传统PCR的修改,由两个顺序扩增反应组成,实时PCR是传统PCR的变体,能够量化扩增的产物。因此,这是常规嵌套和实时PCR分析之间的关键区别。与常规和实时PCR不同,嵌套PCR使用两个引物集。此外,嵌套PCR中有两个连续的扩增反应,以减少非特异性扩增。此外,常规和实时PCR分析不包含两个顺序扩增反应。

以下信息图列出了以表格形式进行表面比较的常规嵌套和实时PCR分析之间的差异。

摘要 - 传统与嵌套与实时PCR分析

常规PCR是开发用于扩增DNA特定片段的第一种技术。嵌套的PCR和实时PCR是常规PCR的两个变体。有两个顺序扩增反应,并在嵌套PCR中使用两个引物集。开发实时PCR来量化放大的PCR产品。因此,这总结了常规嵌套和实时PCR分析之间的差异。

参考:

1.格林先生,桑布鲁克J.嵌套聚合酶链反应(PCR)。”冷春港协议,美国国家医学图书馆。
2.“”实时聚合酶链反应。”概述|ScienceDirect主题。

图片提供:

1.“”聚合酶链反应”恩佐洛普(Enzoklop) - 自己的作品(CC BY-SA 3.0)通过Commons Wikimedia
2.“”嵌套的PCR” Zephyris在英语Wikipedia上(CC BY-SA 3.0)通过Commons Wikimedia
3.“”实时PCR”İnformatic - 自己的工作(CC BY-SA 3.0)通过Commons Wikimedia

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提交以下:分子生物学

关于作者:Samanthi博士

Samanthi Udayangani博士拥有B.Sc.植物科学学位,硕士在分子和应用微生物学和应用微生物学中的博士学位。她的研究兴趣包括生物肥料,植物 - 微生物相互作用,分子微生物学,土壤真菌和真菌生态学。

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