关键差异- cDNA vs基因组文库
由科学家利用基因工程技术构建的DNA库主要有两种类型。这是cDNA文库和基因组文库。的关键的区别cDNA和基因组文库之间的差异是cDNA文库中含有克隆的总互补DNA信使核糖核酸而基因组DNA文库包含整个有机体的克隆片段基因组一个有机体。基因组DNA文库比cDNA文库大。
内容
1.概述及关键区别
2.什么是cDNA文库
3.什么是基因组文库
4.并排比较- cDNA与基因组文库
5.总结
什么是基因组文库?
基因组DNA文库是一个集合克隆承载着碎片的总基因组DNA一个有机体。它包含了该生物的全部基因组DNA,包括编码和非编码序列。基因组文库的建设是由重组DNA技术,然后克隆(基因工程)。如图01所示,构建过程中涉及到不同的步骤。这个过程从基因组DNA分离开始。使用合适的DNA提取方案,应分离出生物体的总基因组DNA。然后通过限制性内切酶(DNA切割酶)将DNA转化为可管理的大小或特定的片段。利用DNA连接酶(DNA连接酶)将片段DNA插入载体。载体是一种自我复制的有机体。质粒在DNA重组技术中,噬菌体是常用的载体。这些连接载体被称为重组DNA分子,因为它们携带自己的和插入的DNA序列。将重组载体加入到宿主细菌中,并使其在细菌细胞内摄取重组载体。带有重组载体(质粒)的细菌应在培养基中培养。在细菌繁殖过程中,细菌DNA与重组质粒一起复制它们的基因组并产生克隆。这些克隆包含源生物的全部基因组。因此,它被称为基因组文库。质粒可以很容易地从细菌染色体DNA中分离出来,构建该生物体的基因组文库。如果一个特定的生物体含有感兴趣的基因,那么很容易在基因组文库中发现它杂交使用分子探针(标记)。
基因组文库对于研究基因组的结构与功能、特定基因、基因定位、基因定位、突变基因测序、新治疗基因鉴定等。
什么是cDNA文库?
cDNA文库是一系列的互补DNA(互补)从总量合成的克隆信使核糖核酸一个有机体。施工过程涉及不同的步骤。从生物体中提纯总mRNA是所涉及的第一步。分离出来的mRNA通过逆转录转化为cDNA链。逆转录是由一种叫做逆转录酶的酶促进的。它使用一个小的3 '引物,开始合成与模板mRNA链互补的第一个cDNA链。用限制性内切酶将得到的双链cDNA转化为更小的片段,插入到合适的载体中。这些构建的重组分子然后被添加到宿主有机体中,并在培养基中生长以产生克隆。含有生物cDNA片段的克隆集合被称为cDNA文库。完全切片的成熟mRNA不包含内含子和调控区。 Therefore non-coding fragments are not present in cDNA libraries unlike in a genomic library.
cDNA文库在分析基因编码区、基因功能、基因表达等方面具有重要意义。
cDNA和基因组文库有什么不同?
cDNA vs基因组文库 |
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cDNA文库是生物mRNA中含有互补DNA的克隆的集合 | 基因组文库是包含有机体基因组DNA总量的克隆的集合。 |
编码序列与非编码序列 | |
cDNA文库只包含编码序列;它不包含内含子。 | 基因组文库包括整个基因组DNA,包括非编码DNA(内含子和调控DNA)。 |
大小 | |
cDNA文库小。 | 基因组文库庞大。 |
起始物料 | |
起始物质是信使rna | 起始物质是DNA。 |
反向转录的参与。 | |
逆转录发生在第一个cDNA链合成过程中。 | 逆转录不会发生。 |
摘要- cDNA和基因组文库
基因组文库代表一个群体的克隆承载碎片的总基因组DNA的有机体。cDNA文库是一个生物的总mRNA中含有互补DNA的克隆群体。一个cDNA克隆只包含在mRNA中发现的序列,而基因组克隆包含整个基因组的序列。这就是cDNA和基因组文库的区别。
参考:
1.哈尼夫,Deena T KochunniJazir。基因组与cDNA文库的差异。基因组文库与cDNA文库的差异。n.p., n.d. 2017年2月15日
2.Stekel, Dov J., Yoav Git和Francesco Falciani。“多个cDNA文库中基因表达的比较”基因组研究。冷泉港实验室出版社,2000年12月。2017年2月16日
3.大肠杆菌耐正丁醇基因的基因组文库筛选大肠杆菌耐正丁醇基因的基因组文库筛选。n.p., n.d. 2017年2月16日
图片来源:
1.《cDNA文库的形成》,作者:Dre博士,英文维基百科(3.0 CC冲锋队)通过下议院维基
2.“基因组文库建设”由Aluquette -自己的工作(3.0 CC冲锋队)通过下议院维基
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