的关键的区别在螺旋-环-螺旋和螺旋-转-螺旋之间是螺旋-环-螺旋介导蛋白质吗二聚虽然helix-turn-helix调节基因表达通过DNA结合。
蛋白质基序是与DNA的不同功能相关的短保守序列。它主要与具有独特化学或生物功能的特殊结构位点有关。这些图案包含不同蛋白质分子的氨基酸的三维结构的小区域。通常,单个主题只包含几个元素。螺旋-环-螺旋和螺旋-转-螺旋包含三个要素。它们的蛋白质结构基序包括不同长度和不确定结构的环。
内容
1.概述及关键区别
2.什么是Helix-Loop-Helix
3.什么是Helix-Turn-Helix
4.相似点- Helix-Loop-Helix和Helix-Turn-Helix
5.螺旋-环-螺旋vs螺旋-转-螺旋表格
6.摘要-螺旋-环-螺旋vs螺旋-转-螺旋
Helix-Loop-Helix是什么?
螺旋-环-螺旋(HLH)是一种蛋白质结构基序,定义了二聚体转录因子的最大家族之一。这些转录因子含有促进DNA结合机制的氨基酸残基,属于二聚体。蛋白质结构基序包含两个α-螺旋,它们由一个环连接。一个螺旋看起来比两个螺旋更小,环的灵活性允许二聚作用,通过对另一个螺旋的堆积和折叠。看起来较大的螺旋通常包含dna结合区。HLH蛋白结合在一个被称为E-box的一致序列上。一致序列是包含核苷酸或氨基酸残基的计算顺序。在一些真核生物中,E-box是一种响应DNA的元件,作为蛋白质结合位点并调节基因表达。
HLH转录因子对发育和细胞活性至关重要。HLH蛋白主要分为6组,从字母A到字母f,每组包含的转录因子有:
A组:MyoD, Myf5, Beta2/NeuroD1, Scl, p-CaMK, NeuroD和Neurogenins,
B组:MAX, C-Myc, N-Myc, TCF4
C组:AhR、BMAL-1-CLOCK、HIF、NPAS1、NPAS3、MOP5
D组;EMC
E组:HEY1、HEY2
F组:EBF1
因为HLH的大部分转录因子是heterodimeric,二聚作用通常对它们进行调控。
Helix-Turn-Helix是什么?
Helix-turn-helix (HTH)是一种能够结合DNA的蛋白质结构基序。每个单体由两个单体组成α螺旋由短的氨基酸链连接。它与DNA螺旋中的凹槽结合。HTH基序通常调控基因表达。HTH的识别和与DNA的结合是通过两个α-螺旋进行的。一个螺旋位于n端,另一个位于c端。在大多数情况下,螺旋进行DNA的识别。因此,它被称为识别螺旋。与DNA沟槽的结合是通过一系列的范德华作用和暴露碱基的氢键进行的。另一个α-螺旋稳定蛋白质和DNA的相互作用,在识别中不发挥主要作用。然而,识别螺旋和剩余螺旋具有相似的方向。
HTH是根据螺旋的结构和空间安排来分类的。主要类型有双螺旋、三螺旋、四螺旋和有翼HTH。双螺旋型是最简单的类型,有两个螺旋和一个独立的折叠蛋白结构域。三螺旋型存在于转录激活剂Myb中。四螺旋型有一个额外的c端螺旋。最后,翼型HTH由3螺旋束和3或4股β薄片组成。
螺旋-环-螺旋和螺旋-转-螺旋之间有什么相似之处?
- 螺旋-环-螺旋和螺旋-转-螺旋是蛋白质结构基序。
- 两者在基础转录因子和特异性转录因子中都有共同的分母。
- 它们存在于真核生物中。
螺旋-环-螺旋和螺旋-转-螺旋的区别是什么?
螺旋-环-螺旋介导蛋白质二聚,而螺旋-转-螺旋通过与DNA结合调节基因表达。因此,这就是helix-loop-helix和helix-turn-helix的关键区别。此外,HLH包含编码转录因子的某些原癌基因和参与分化的基因,而HTH包含许多编码转录因子的同型异型基因。此外,helix-loop-helix主要由α -螺旋组成,由一个环连接,而helix-turn-helix主要由一个短氨基酸支架连接,形成一个槽。
下面的信息图以表格的形式并排比较了螺旋-环-螺旋和螺旋-转-螺旋的区别.
摘要-螺旋-环-螺旋vs螺旋-转-螺旋
蛋白质基序是与DNA的不同功能相关的短保守序列。螺旋-环-螺旋和螺旋-转-螺旋是两种蛋白质结构基序。helix-loop-helix和helix-turn-helix的关键区别在于,螺旋-loop-helix介导蛋白质二聚,而螺旋-turn-helix通过与DNA结合调节基因表达。HLH是一种蛋白质结构基序,定义了最大的二聚转录因子家族之一。蛋白质结构基序包含两个α-螺旋,它们由一个环连接。HTH是一种能够结合DNA的蛋白质结构基序。每个单体由两个α-螺旋组成,并由短的氨基酸链连接,并与DNA螺旋中的凹槽结合。这就是螺旋-环-螺旋和螺旋-转-螺旋的区别。
参考:
1.”基本Helix-Loop-Helix《科学直接话题概述》。
2.”Helix-Turn-Helix《科学直接话题概述》。
图片来源:
1.”基本螺旋线“我,斯普利特(3.0 CC冲锋队)通过共享维基
2.”3个TetR家族成员的HTH比对“Gabbiochem -使用PyMol基于PDB: 5DY0沉积的Palanca &Rubio, PDB: 3VIB沉积于Kumaraswami, Shafer,“Brennan,和PDB: 3ZQL沉积于Le, Schumacher, Lawson, Brennan”;Buttner3.0 (CC)通过共享维基
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