这关键区别在随机引物和寡核DT之间随机底漆是所有可能的己酰胺寡核苷酸序列的混合物,而寡核DT引物由单链脱氧噻天胺胺组成。
逆转录是一种机制cDNA可以使用mRNA或任何种类的RNA。为了产生cDNA,应提供逆转录酶和其他必要的成分,尤其是模板和引物。底漆是专门设计用于扩增目标序列的短DNA序列。随机引物和寡核DT引物是逆转录中使用的两种常见类型的引物。因此,随机引物或寡核DT引物是逆转录酶启动逆转录所需的短DNA寡核苷酸序列。根据RNA模板,可以从这两种引物类型中选择合适的引物。
内容
1。概述和关键差异
2。什么是随机底漆
3。什么是Oligo DT
4。随机引物和寡核DT之间的相似性
5。并排比较 - 随机引物与表格形式的Oligo DT
6。概括
什么是随机底漆?
随机底漆是代表所有可能的六聚体序列的寡核苷酸的混合物。随机引物的引物序列为5´– D(nnnnnn)–3´ n = g,a,t或C。因此,随机引物可用于通过DNA聚合酶或逆转录酶的单链DNA或RNA的扩增,或反向转录酶,或分别。此外,随机底漆混合物能够扩增RNA的所有区域以产生cDNA。因此,它会产生各种长度的cDNA。
最重要的是,随机引物混合物未显示模板特异性。它无法区分mRNA和其他RNA物种。而且,它可以用样品中的任何RNA退火。然而,随机底漆混合物适用于没有poly(a)尾巴的RNA的逆转录,例如RRNA,tRNA,非编码RNA,小rNA,原核mRNA等,带有已知二级结构的RNA和RNA。
什么是Oligo DT?
Oligo DT底漆是12-18脱氧胸苷(DT)。引物序列可以表示为5´-D(TTT TTT TTT TTT TTT TTT TTT TTT)-3。它用于从含有聚(A)尾巴的mRNA产生cDNA。基本上,它充当逆转录酶催化的反应的底漆。在逆转录过程中,在大多数真核生物mRNA的3端发现的多腺苷酸化尾巴的寡戊酰化尾部,并开始该过程。
与随机底漆不同,Oligo DT底漆不适合缺少聚(A)尾巴的RNA或RNA,包括原核RNA和microRNA。
随机引物和寡核DT之间有什么相似之处?
- 随机引物和寡核DT引物是两种类型的引物,用于逆转录和制作cDNA。
- 使用随机底漆和寡核DT引物一起增加了cDNA合成的敏感性。
- 它们是单链短核苷酸序列。
随机引物和寡核DT有什么区别?
随机引物是由随机序列组成的短寡核苷酸序列。同时,Oligo DT引物是由12至18种脱氧腺苷组成的短链。因此,这是随机引物和寡核DT之间的关键区别。随机引物的序列为5´–d(nnnnnn)–3´ n = g,a,t或C。而寡核DT引物的序列为5´-d(ttt ttt ttt ttt ttt ttt ttt ttt ttt ttt)-3”。因此,我们可以将其视为随机引物和寡核DT之间的另一个区别。
此外,随机引物不显示模板特异性,它们可以用任何种类的RNA退火,而寡核DT引物显示出对真核mRNA的poly(a)尾巴的特异性。
以下信息图总结了随机引物和寡核DT之间的差异。
摘要 - 随机引物与寡核DT
随机引物和寡核DT引物是用于cDNA合成的两种类型的引物。随机底漆由寡核苷酸的混合物组成,代表所有可能的己酯序列,而寡核苷酸序列是12至18个脱氧噻天胺胺的单链序列。因此,这是随机引物和寡核DT之间的关键区别。此外,寡核DT引物可用于用poly(a)尾巴的RNA的全长逆转录,而随机引物可用于大多数RNA物种的反向转录,包括降解的RNA,缺乏poly(a)尾巴和RNA的RNA二级结构。因此,随机引物未显示模板特异性,而寡核DT引物显示出对含有聚(A)尾巴的真核mRNA的特异性。
参考:
1.“逆转录设置:Thermo Fisher Scientific - 美国。”逆转录设置|Thermo Fisher Scientific - 美国,在这里可用。
图片提供:
1. Zephyris的“ Primers Revcomp” - 自己的作品(CC BY-SA 3.0)通过下议院维基梅迪亚
2. Lokeshthimmana的“ RT PCR模型” - 自己的作品(CC BY-SA 4.0)通过下议院维基梅迪亚
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